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中国水科院黄海水产研究所完成国际首个蚶科基因组参考图谱

日期:2019-11-21 03:27

  日前,在国家重点研发计划和贝类产业技术体系等项目支持下,黄海水产研究所王崇明研究员团队、杨爱国研究员团队与德国阿尔弗雷德·韦格纳研究所赫尔姆霍兹极地和海洋研究中心Umberto Rosani博士等合作,成功破译魁蚶基因组,研究成果于7月9日正式发表在GigaScience杂志。

  该研究利用第二、三代测序和Hi-□◁C染色体构象捕获技术,构建了国际上首个染色体水平的蚶科动物基因组参考图谱。研究揭示魁蚶基因组大小为885 Mb,Scaffold N50达到45 Mb,利用Hi-C技★-●=•▽术成功将99.35%的组装序列挂载到染色体上,经进一步分析发现▼▲魁蚶▲★-●基因组中重复序列高达408 Mb,占基因组总▼▼▽●▽●长的46%。

  魁蚶俗▲●…△称赤贝、血贝、大毛蛤,是一种大型海洋底栖经济贝◁☆●•○△类,广泛分布于太平洋西北部的◇=△▲日本海、黄海、渤海及东海沿岸,成贝个大体▽•●◆肥,肉质鲜美,经济价◆◁•值较高。近年来,我国魁蚶苗种生产和增养◆▼殖规模不断扩大,经济和社会▪•★效益显著,然而其种质质量下降、病害高发等问题日趋严重。魁蚶及蚶科贝类基因组信息的匮乏成为我们理解其抗病、抗逆机制的◆●△▼●障碍,破译魁蚶基因组信息、开展重要性状△▪▲□△遗传改良成为当下的重要课题。该项研究成果为蚶科贝类抗病抗逆、生长发育等重要性状的遗传解析以及种质改良等相关研究提供了重要理论支撑。

  黄海水产研究所白昌明博士、辛鲁生博士为该论文的共同第一作者,王崇明研究员为该论文的通讯作者。

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